Församlingen är en av de äldre föreningarna och församlingarna i Sävsjö och bildades 1863, för cirka 160 år sedan. När Södra stambanan mellan Stockholm och Malmö var färdig 1864 var Sävsjö ett av stoppen och blev ett växande samhälle från nästan ingenting till dagens kommun.

Samhällsbyggandet ökade med bostadshus, och industrifastigheter. Den växande väckelserörelsen under senare delen av 1800-talet kom också till Sävsjö. Behovet att höra Guds ord var stort, först i hemmen och senare i samlingslokaler.

År 1863 samlade några missionsvänner och en tomt skänktes för att bygga en lokal. Förmodligen byggdes missionshuset 1867-68. Väckelsevindarna blåste över hela vårt land och på 1870-80 talet och det lilla missionshuset räckte inte till. Beslut fattades 1877 att ta ner den lilla lokalen och använda en del av materialet till att bygga en stor kyrka att samlas i. Kyrkan har byggts om och renoverats vid ett flertal tillfällen. Den rymmer cirka 200 personer i nedre plan och nästan lika många på läktaren.

I augusti 2025 äverlät Missionsförsamlingen kyrkobyggnaden till församlingen Guds Kraft som kommer fortsätta att bedriva verksamhet i lokalerna.

Missionsförsamlingen fortsätter att samlas till gudstjänst.

Sävsjö Missionsförsamling är en del av Equmeniakyrkan som bildades av Missionsförbundet, Metodistkyrkan och Svenska Baptistsamfundet.